2016年1月26日，中国疾病预防控制中心妇幼保健中心在北京举办了“2016年全国省级妇幼保健机构院长年会”，来自全国省、自治区、直辖市及部分计划单列市妇幼保健院（所、中心）的院长、副院长等共计60余人参加了会议。
2016年2月19日，第一届中国妇幼健康科技大会暨“首届妇幼健康科学技术奖”颁奖会在北京人民大会堂隆重举行。中国疾病预防控制中心妇幼保健中心的“孕产妇危重症评审方法在中国的建立与推广应用研究”与“儿童睡眠模式及相关健康问题的预防策略和关键技术研究”分别获得科技成果二等奖。妇女卫生保健部主任吴久玲和儿童卫生保健部主任王惠珊作为研究组负责人参会并上台领奖。
2016年4月6-8日，妇幼分会2016年常务理事扩大会议在福州召开。来自全国各级妇幼保健机构的党委书记（院长）和党办主任70余人参加了会议。
2016年5月17日，经2016年第5次中国疾病预防控制中心妇幼保健中心党政联席会研究决定，聘任韩晖同志为中国疾病预防控制中心妇幼保健中心国际合作项目部副主任，试用期一年。
2016年5月18-19日，受国家卫生计生委妇幼司委托，中国疾病预防控制中心妇幼保健中心（以下简称“妇幼中心”）在江苏省南京市举办了全国儿童保健工作推进会。国家卫生计生委妇幼司宋莉副司长、儿童处曹彬处长， 江苏省卫生计生委李少东副主任、妇幼处王晓芳处长，妇幼中心金曦副主任等领导出席了开幕式。来自全国各省、自治区、直辖市、新疆生产建设兵团、各计划单列市卫生计生委妇幼处儿童保健工作负责人，妇幼保健机构分管院（所）领导、儿童保健部门主任共130余人参加了会议。。
2016年5月20日上午，在国家卫生计生委和全国妇联联合指导下，由中国疾病预防控制中心妇幼保健中心、中国妇女活动中心共同主办的2016年“妇幼健康中国行”活动启动仪式在天津市举行。国家卫生计生委妇幼司、中国疾病预防控制中心妇幼保健中心、中国妇女活动中心、天津市政府、市卫生计生委、以及各区县卫生计生委、市、区县妇幼保健机构有关负责同志、基层医疗卫生机构助理遗传咨询师、专家和媒体约400人参加了启动仪式。
2016年5月26日上午，在国家卫生计生委和全国妇联联合指导下，由中国疾病预防控制中心妇幼保健中心、中国妇女活动中心共同主办的“2016年妇幼健康中国行走进湖北 走进大别山”活动启动仪式在湖北黄岗市红安县举行。国家卫生计生委妇幼司、中国疾控中心妇幼中心，湖北省、市(州)卫生计生委，湖北省大别山区2市8县卫生局，省、市（州）、县妇幼保健院以及省计划生育药具管理站、省计划生育科技服务中心负责人以及省卫生计生委机关相关处室负责同志，基层医疗卫生机构、媒体以及群众代表约300人参加了启动仪式。
2016年5月26日，中国疾病预防控制中心妇幼保健中心（以下简称“妇幼中心”）在广东省珠海市组织召开省级妇幼保健机构办公室管理工作交流会。国家卫生计生委妇幼司综合处处长许宗余、妇幼中心主任张彤、主任助理杨琦、广东省妇幼保健院院长黄汉林、广西壮族自治区卫生计生委办公室副主任戴前富、珠海市卫生计生局副局长李子松、珠海市妇幼保健院院长吕承简、副院长贝伟红出席会议并致辞。会议由妇幼中心综合办公室主任聂妍主持。来自部分省、自治区、直辖市、计划单列市妇幼保健机构办公室主任和珠海市妇幼保健院办公室、保健部的50余名同志参加了会议。
2016年5月31日,由国家卫生和计划生育委员会、中华全国妇女联合会指导，中国疾病预防控制中心妇幼保健中心、中国妇女活动中心主办，重庆市卫生和计划生育委员会、江北区人民政府承办,以“情系山水重庆城，共筑妇幼健康梦”为主题的“妇幼健康中国行”走进重庆活动启动仪式在重庆市江北区举行。重庆市主城九区卫生计生委、市人口计生研究院、市妇幼保健院、市药具管理中心等机构相关负责人、妇幼保健专家及市民群众近2000余人参加了启动仪式。
2016年7月7-8日，新生儿复苏项目十周年总结会暨培训班在北京召开。国家卫生计生委妇幼司、联合国儿童基金会、美国儿科学会、中国疾控中心妇幼中心、新生儿复苏项目国家级师资代表、31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团卫生计生委和省级师资代表150余人参会，共同庆祝项目实施10年取得的成绩，见证第三周期新生儿复苏项目的启动。
2016年7月29日，第25个“世界母乳喂养周”来临之际，中国疾控中心妇幼中心与西藏自治区卫生计生委、西藏自治区人民医院联合在拉萨举办世界母乳喂养周活动，将温暖雪域的爱传递到全国。
2016年9月20-22日，妇幼中心在湖南省长沙市举办了全国省级妇幼保健机构健康教育管理培训班暨健康教育工作会，来自全国省级妇幼保健机构领导及健康教育科负责人60人参加了此次会议和培训。
2016年 9月22-23日，国家卫生计生委-联合国儿童基金会消除艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播试点项目专家讨论会在北京召开，国家卫生计生委妇幼司司长秦耕、联合国儿童基金会中国办公室代表花楠女士、中国疾控中心妇幼中心主任张彤出席会议并致辞。来自世界卫生组织、联合国儿童基金会、联合国艾滋病规划署、美国疾病预防控制中心驻泰国办事处及国内预防母婴传播相关领域的专家60余人参加会议。
2016年9月29日，受国家卫生计生委妇幼司委托，妇幼中心在云南省昆明市举行妇幼健康扶贫工作座谈会暨西部地区妇幼卫生能力提升项目总结会。国家卫生计生委妇幼司司长秦耕、财务司副司长刘魁出席会议并讲话。
2016年10月17-31日,受外交部委托，由妇幼中心国际合作项目部承担的第二届中国-阿富汗妇幼卫生培训班在华成功举办，来自阿富汗8个省的14名学员参加了此次培训，培训内容涉及妇幼保健、临床、项目管理等，并受到学员一致好评，希望将中国妇幼卫生可借鉴的成功经验引入本国。
2016年10月18-27日，受国家卫生计生委妇幼司委托，妇幼中心政研室组织承办了4期“妇幼保健院评审标准培训班”，31个省、市、自治区的卫计委妇幼处及评审组织实施单位负责人和妇幼保健辖区业务管理、妇幼健康服务、医技管理、护理管理、药事管理、机构管理等专业领域的省级妇幼保健院评审专家共650人参加了培训。
2016年11月9日，“母婴健康信使-公益短信项目”在广西南宁启动，自项目于2015年10月和2016年1月分别在河北、湖南启动以来，已为5万余名孕产妇及其家庭发送了268万条免费健康知识短信。
2016年11月25日，聘任汪金鹏同志为中国疾病预防控制中心妇幼保健中心党群工作办公室副主任。
2016年11月25日，聘任张悦同志为中国疾病预防控制中心妇幼保健中心儿童卫生保健部副主任。
2016年11月30日，妇幼中心承担的“儿童重大公共卫生服务项目培训工作总结会”在京举办。我中心受到国家卫生计生委妇幼司表彰，并授予“突出贡献奖”。
2016年12月8日，2016年全国爱婴医院工作会在北京召开，来自全国各省、自治区、直辖市、新疆生产建设兵团卫生计生委妇幼处和省妇幼保健院的负责同志共110人参加了会议。国家卫生计生委妇幼司宋莉副司长、妇幼中心主任张彤出席开幕式并致辞。
妇幼中心完成2008年4月-2016年6月党费补缴工作。
